お客さまサーバーに設置している .htaccess ファイルにphpの旧バージョンに関する記述（※）がある場合、正常にバージョンをアップすることができません。
旧バージョンに関する記述があった場合、削除を行ったうえであらためてサイトマネージャーからご希望のバージョンへ変更してください。

（※）例：.htaccess でPHPバージョン5.3を指定する場合
　　　　AddHandler application/x-httpd-php53 .php